Zastępca Naczelnika jest upoważniony do podejmowania rozstrzygnięć, podpisywania pism i zajmowania stanowiska we wszystkich sprawach z zakresu bezpośrednio nadzorowanych komórek organizacyjnych, niezastrzeżonych w regulaminie lub w odrębnych przepisach do ostatecznej aprobaty Naczelnika Urzędu, a w szczególności:

1. koordynowania działalnością komórek organizacyjnych Urzędu bezpośrednio mu podporządkowanych,
2. decydowania w sprawach nie zastrzeżonych do kompetencji Naczelnika Urzędu, a dotyczących spraw lub pracowników nadzorowanego pionu,
3. organizowania szkoleń specjalistycznych i instruktażu ogólnego dla pracowników nadzorowanego pionu,
4. kontroli przestrzegania dyscypliny pracy, tajemnicy państwowej, służbowej i skarbowej przez bezpośrednio podległych pracowników,
5. wstępnej aprobaty decyzji lub innych rozstrzygnięć w sprawach zastrzeżonych do kompetencji Naczelnika Urzędu,
6. opiniowania wniosków w sprawach osobowych pracowników nadzorowanego pionu tj. angażowania, zwalniania, awansowania, przeszeregowania, karania i nagradzania pracowników,
7. aprobata stanowiska Urzędu stanowiącego ustosunkowanie się do zarzutów przedstawionych w odwołaniu do wydanych decyzji w I instancji w komórkach bezpośrednio mu podporządkowanych,
8. koordynacji i nadzoru nad obiegiem dokumentów w tym przetwarzanych w systemie informatycznym.