Zastępca Naczelnika sprawuje bezpośredni nadzór nad następującymi pionami i komórkami organizacyjnymi:
- Pion Orzecznictwa:
- Wieloosobowe stanowisko podatków dochodowych i podatku od towarów i usług oraz podatków majątkowych i sektorowych,
- Pion Kontroli:
- Referat Czynności Analitycznych i Sprawdzających oraz Identyfikacji i Rejestracji Podatkowej;
- Wieloosobowe Stanowisko Kontroli Podatkowej;
- Jednoosobowe Stanowisko Spraw Karnych Skarbowych.
